基于深度学习的像差补偿提高显微镜的对比度和分辨率

发布:cyqdesign 2025-01-08 08:02 阅读:37

深度衰减是生物学家非常熟悉的一个问题: 观察样本越深,图像就越模糊。一个蠕虫胚胎或一块组织可能只有几十微米厚,但当显微镜仪器探查到顶层之外时,光线的弯曲会导致显微镜图像失去清晰度。

为了解决这个问题,显微镜学家在现有的显微镜上增加了一些技术,以消除这些扭曲。但这种被称为自适应光学的技术需要时间、资金和专业知识,因此能使用这种技术的生物实验室相对较少。

现在,HHMI Janelia 研究园区的研究人员与合作者开发出了一种方法,可以进行类似的校正,但不需要使用自适应光学技术,不需要添加额外的硬件,也不需要拍摄更多的图像。来自 Shroff 实验室的一个团队开发出了一种新的人工智能方法,可以在厚厚的生物样本中生成清晰的显微镜图像。

论文发表在《自然·通讯》(Nature Communications)杂志上。

基于深度学习像差补偿的概念和模拟

为了创造这项新技术,研究小组首先想出了一种方法,为显微镜深入均匀样本成像时图像如何退化建立模型。然后,他们将模型应用于同一样本未退化的近侧图像,使这些清晰的图像变得与更深的图像一样扭曲。然后,他们训练了一个神经网络来扭转整个样本的失真,从而在样本的整个深度获得清晰的图像。

这种方法不仅能生成更好看的图像,还能让研究小组更精确地计算蠕虫胚胎中的细胞数量,追踪整个小鼠胚胎中的血管和血管束,并检查小鼠肝脏和心脏碎片中的线粒体。

这种基于深度学习的新方法不需要任何设备,只需要一台标准显微镜、一台带显卡的计算机和一个关于如何运行计算机代码的简短教程,因此比传统的自适应光学技术更容易获得。

Shroff 实验室已经在使用这项新技术为蠕虫胚胎成像,该团队计划进一步开发该模型,使其对样本结构的依赖性降低,这样新方法就能应用于不太均匀的样本。

相关链接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-55267-x

分享到:

最新评论

我要发表 我要评论
限 50000 字节
关于我们
网站介绍
免责声明
加入我们
赞助我们
服务项目
稿件投递
广告投放
人才招聘
团购天下
帮助中心
新手入门
发帖回帖
充值VIP
其它功能
站内工具
清除Cookies
无图版
手机浏览
网站统计
交流方式
联系邮箱:广告合作 站务处理
微信公众号:opticsky 微信号:cyqdesign
新浪微博:光行天下OPTICSKY
QQ号:9652202
主办方:成都光行天下科技有限公司
Copyright © 2005-2025 光行天下 蜀ICP备06003254号-1