世界首个便携式DNA“三录仪”问世
英国《大数据科学》杂志7日介绍了世界上第一个口袋大小的脱氧核糖核酸(DNA)分析设备,该设备能让研究人员随时随地进行基因组测序。 据合众国际社网站12月7日报道,这种设备令人想起了《星际迷航》宇宙中使用的“三录仪”。它将一个移动手持DNA测序仪与一款名为iGenomics的苹果手机新应用程序结合在一起。 报道称,美国科尔德斯普林实验室一个科学家团队开发的这款应用是首个此类移动基因组测序分析仪。 这款应用的算法可以用来识别多种病毒病原体,包括流感病毒和寨卡病毒的不同毒株。科学家说,他们可以用这个现实中的“三录仪”来识别病毒变异,而这对于诊断和治疗十分重要。 现任脸书网站软件工程师的阿斯平·帕拉特尼克在科尔德斯普林实验室兼职副教授迈克尔·沙茨的实验室里学习和工作时编写了iGenomics程序。 帕拉特尼克和沙茨意识到,DNA测序设备变得越来越小,却没有软件可以利用这些便携设备。 帕拉特尼克在新闻稿中说:“对DNA的大部分研究——校准和分析——都是在大型服务器集群或高端笔记本电脑上进行的。” 据报道,要在现场进行基因分析,研究人员就不得不携带重型设备。帕拉特尼克和沙茨希望,除了减轻研究人员的行李重量外,他们的新技术还将使基因组分析变得更方便,也更便宜。 报道称,利用苹果手机,科学家们甚至可以相互“隔空投送”测序数据,并在没有互联网的偏远地区进行分析。 研究人员希望,国际空间站上的宇航员不久也能用上他们的iGenomics。 对于iGenomics的早期使用者,特别是那些研究当前新冠疫情的人,沙茨和帕拉特尼克提供了在生物样本中检测新冠病毒基因碎片的教程。 报道指出,新冠疫情的快速传播性迫使许多科学家调整了研究方法。沙茨和帕拉特尼克希望像iGenomics这样的技术能够有所帮助。 沙茨说:“如今,我们大家的口袋里都有了专业摄像头,因此不难想象几年后,我们也都可以在智能手机上携带自己的DNA测序仪。我们有那么多的机会去测量我们的环境和寻找病原体,甚至可以对自己进行扫描。” |