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小火龙果 2023-06-01 09:19

直通 Wolfram 研发:Wolfram 化学概览

(h:Rh  
6Aocm R0D'  
qe5feky  
[attachment=118230]
/*0K92NB  
内容大纲
Bj7gQ%>H4  
  • Wolfram语言中的化学简史
     T Q,?>6n  
    ChemicalData -> Entity -> Molecule
    5h;+Ky!I  
化学表达式
_YRE (YZ/  
  • ChemicalFormula
  • ChemicalReaction
  • MoleculeName
  • FindIsomers
    Ci rZ+o  
分子可视化
GgKEP,O  
  • 原子和键合标签
  • 新的绘图功能
    5ZBKRu  
模式匹配
oY, %Iq  
  • MoleculeMatchQ
  • MoleculeSubstructureCount, MoleculeContainsQ, MoleculeFreeQ
     O#I1V K  
化学转换
FeaturespacePlot
Wolfram化学资源
z?35=%~w   
0Lb4'25.  
Wolfram 语言中的化学简史
Kv~U6_=1O  
[attachment=118231]
  • ChemicalData
    K$d$m <  
[attachment=118232]
n0is\ZK 0  
化学表达式
)m. 4i=X  
[attachment=118233]
[attachment=118234]
"Chemical" 实体
zl`h~}I  
  • 从第10版开始,实体为Wolfram知识库提供了一个统一的接口
  • 扩展了查询多个实体或多个属性的语法
    V*~Zs'L'E  
    [attachment=118235]
uG<}N=  
Molecule:一个可计算的化学对象
  • 第12版引入了Molecule,一个可计算的对象,可以代表任何单一的分子:
    Po%(~ )S>  
[attachment=118236]
t45Z@hmcW  
一个分子是由原子和键组成的: &iV{:)L  
[attachment=118237]
I|Gp$ uq _  
分子属性按需计算:  Tgl}  
[attachment=118238]
_Zr.ba  
可以通过 MoleculeModify 轻松改变结构:
[attachment=118239]
- |gmQG  
[attachment=118240]
rXHv`k y  
[attachment=118241]
N?.%?0l  
[attachment=118242]
A%^ILyU6c  
[attachment=118243]
{^N[("`  
ChemicalFormula ~ar=PmYV7  
  • 一个 "化学 "实体代表一个在知识库中具有记录的单一化学物类,其具有完整的属性,如熔点、比热容等;
  • 一个分子可以是任何化学结构,必须有指定的连通性;
  • 化学式(ChemicalFormula)只有一个原子类型及其系数的列表——它代表具有给定公式的任何(或所有)化学物类。
    [attachment=118244]
    r hfb ftw  
ccL~#c0P7  
  • 化学式有明确的分子质量和电荷:
    [attachment=118245]
    h\'n**f_x  
4 uQT5  
  • 一个分子可以与一个给定的公式相匹配
    4!wR_@W^El  
[attachment=118246]
\nP>:5E1  
e#k<d-sf6  
ChemicalReaction
[attachment=118247]
wm^J;<T[  
获取反应物或产物: wiBVuj#  
[attachment=118248]
y8DhOlewQ  
获取产物的计数:
[attachment=118248]
y\x+  
显示反应式: c ;'[W60  
!*OJ.W&  
根据方程式串创建化学反应:
Y5j]Z^^v  
这里的输入被解释为化学式:
m?&1yU9  
根据 ReactionSMILES 字符串创建化学反应:
)K2HK&t:  
在这里,反应的组成部分是分子对象: &@3H%DP}Ql  
Exk\8,EGqS  
分子可视化
使用 IUPAC 名称创建分子。 Cn[0(s6  
使用绘图主题来控制是否显示氢或如何描述芳烃键。
kTvd+TP4  
x@Hc@R<!  
MoleculePlot3D 有助于快速生成交互式绘图,其绘图主题对应于常见情形。
>i6yl5s  
通过参考原子索引来突出原子或键。 1w&!H ]%{  
} GiHjzsR  
AtomLabels
  • AtomLabels BondLabels MoleculePlot MoleculePlot3D 的新选项。 -xP!"  
.e3+s*  
.AU)*7Gh  
\oZ5JoO  
J.| +ID+  
`F>O;>i''  
范例: 分子图,按其氧化状态标记所有的碳原子和氮原子 +="e]Yh;  
]i)j3 WDz]  
W='> :H  
6!(@@^7{*  
f^.AD-  
::/j$bL  
模式匹配
MoleculeMatchQ }3L@J8:D"  
  • 加入其他 Molecule 模式匹配函数: 0xXC^jx:  
    d09k5$=gJ  
  • FindMoleculeSubstructure
  • MoleculeContainsQ
  • MoleculeFreeQ
  • MoleculeSubstructureCount
    IOV(seEY  
检验两个分子是否相互匹配:
f-7 1~  
检验分子是否与化学式相匹配: <(-hx+^  
pLzk   
检验分子是否与模式相匹配: :dqn h  
5O6hxcMjT  
D N*t~Z3[  
一个双原子分子可以与键相匹配: TU 1I} ,  
'uxX5k/D@t  
I'0@viF"Nx  
,kn"> k9  
默认情况下,立体异构体之间不匹配: $ <#KA3o\  
qhz]Wm P   
范例:绘制糖的二维图,用原子的立体感来标记原子 >cCR2j,r  
ok4@N @  
'^"6+k  
;y2/-tL?  
范例:使用子结构模式过滤异构体列表 xcf%KXJf6  
  • 找到在氧和氮之间有一个芳香键的咖啡因的异构体,并将它们排列在最大的共同子结构上 JC3m.)/  
  • 本范例使用了 FindIsomers、MoleculeContainsQ、MoleculeMaximumCommonSubstructure 和 MoleculeAlign =Yt R`  
;{%\9nS  
[n$BRk|  
^~A>8CQOU  
4zo5}L `Y  
  • 现在在三维空间中排列所有分子 Z KckAz\#  
Aj4T"^fv  
[YcG(^^  
化学转换
计算 2300 毫克钠所含的毫摩尔数: 4sT88lG4n  
w2'f/  
计算 10 毫升水的分子数: G JqJlgHe  
L-k@-)98  
计算 10 摩尔氦气的体积,单位为立方英尺: gjAIEI  
qDfd.gL  
mA=i)Ga  
有多少摩尔的二磷酸三钙 Ca3(PO4)2 &mtJRfnu  
6gs01c,BA  
计算 Ca3(PO4)2 和 Ca(OH)2  的化学计量比率 2mGaD\?K  
jyZWV L:_  
将 5 克的 Ca(OH)2 转换为 Ca3(PO4)2: H"dJ6  
q*7VqB  
ikSt"}/hd  
FeatureSpacePlot
H,u<|UMM_  
12.3 版本为分子对象引入了新的内置特征提取器。 A'&K/)Z  
Y1J=3Y  
vG"=h%  
 _ "VkGG  
/ :n#`o=;  
x}8yXE"  
Wolfram 化学资源
]h %Wiw  
一个为 Wolfram 世界中化学内容资源而策划的门户。 FK5 <6n,U  
  • 化学工具 AGYc |;  
Wolfram|Alpha——使用自然语言的化学计算器Wolfram|Alpha 笔记本编辑器 ——数字笔记本中的多步骤化学计算Wolfram 演示项目 ——交互式化学演示工具Wolfram 语言——化学函数的分子系列 < RH UH)I  
Wolfram 函数资源库——专业化学函数  N#a$t&  
Wolfram 数据资源库——可计算化学数据组 d5gR"ja  
  • 计算器 k+ty>bP=  
减少认知负荷,促进实验设计中更深层次的化学思维。 cZ2kYn 8  
xM&Wgei]10  
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【13.2.1中英文 Wolfram 软件】欢迎评论区留言
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