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小火龙果 2023-06-01 09:19

直通 Wolfram 研发:Wolfram 化学概览

]-6=+\]   
u>G#{$)  
DhQYjC[  
[attachment=118230]
KUC (n!  
内容大纲
hL\gI(B  
  • Wolfram语言中的化学简史
    QfI)+pf  
    ChemicalData -> Entity -> Molecule
    9s5PJj"u  
化学表达式
&{s`=IeN  
  • ChemicalFormula
  • ChemicalReaction
  • MoleculeName
  • FindIsomers
    /<(d.6T[}:  
分子可视化
[l+1zt0w0  
  • 原子和键合标签
  • 新的绘图功能
    =R M=@X  
模式匹配
/Z:\=0`  
  • MoleculeMatchQ
  • MoleculeSubstructureCount, MoleculeContainsQ, MoleculeFreeQ
    c3\z  
化学转换
FeaturespacePlot
Wolfram化学资源
t~xp&LQiY  
_084GK9{W  
Wolfram 语言中的化学简史
zSYh\g"  
[attachment=118231]
  • ChemicalData
    I_Q*uH.Y5  
[attachment=118232]
2:(h17So  
化学表达式
kf3yJP/  
[attachment=118233]
[attachment=118234]
"Chemical" 实体
(6C%w)8'  
  • 从第10版开始,实体为Wolfram知识库提供了一个统一的接口
  • 扩展了查询多个实体或多个属性的语法
    J?ljq A}i  
    [attachment=118235]
z0;+.E!  
Molecule:一个可计算的化学对象
  • 第12版引入了Molecule,一个可计算的对象,可以代表任何单一的分子:
    w[>/(R7im  
[attachment=118236]
E%CJM+r!  
一个分子是由原子和键组成的: N'L3Oa\%  
[attachment=118237]
Td&w  
分子属性按需计算: ~-+lZ4}  
[attachment=118238]
l vuoVINEp  
可以通过 MoleculeModify 轻松改变结构:
[attachment=118239]
~E2xIhV  
[attachment=118240]
\W<r`t4v  
[attachment=118241]
( }DCy23  
[attachment=118242]
bg\~"  
[attachment=118243]
S[o_$@|  
ChemicalFormula AiXxn'&i  
  • 一个 "化学 "实体代表一个在知识库中具有记录的单一化学物类,其具有完整的属性,如熔点、比热容等;
  • 一个分子可以是任何化学结构,必须有指定的连通性;
  • 化学式(ChemicalFormula)只有一个原子类型及其系数的列表——它代表具有给定公式的任何(或所有)化学物类。
    [attachment=118244]
    O87Ptr8  
^Zh YW  
  • 化学式有明确的分子质量和电荷:
    [attachment=118245]
    ,UFr??ZKm  
pN+lC[C  
  • 一个分子可以与一个给定的公式相匹配
    !]tZE%?  
[attachment=118246]
D`=hP( y^  
N?d4Pu1m  
ChemicalReaction
[attachment=118247]
d#@N2  
获取反应物或产物: 9aw- n*<  
[attachment=118248]
'1{#I/P;  
获取产物的计数:
[attachment=118248]
V$Y5EX  
显示反应式: hP4*S^l  
4Fr0/="H  
根据方程式串创建化学反应:
\lVX~r4  
这里的输入被解释为化学式:
v)(tB7&`=  
根据 ReactionSMILES 字符串创建化学反应:
I|=$.i  
在这里,反应的组成部分是分子对象: ?XVJ$nzW  
jiPV ]aVN  
分子可视化
使用 IUPAC 名称创建分子。 pq`Bg`c  
使用绘图主题来控制是否显示氢或如何描述芳烃键。
;C8'7  
lZTD>$  
MoleculePlot3D 有助于快速生成交互式绘图,其绘图主题对应于常见情形。
X!0s__IOc  
通过参考原子索引来突出原子或键。 hB#z8D  
@P:  
AtomLabels
  • AtomLabels BondLabels MoleculePlot MoleculePlot3D 的新选项。 SSANt?\Z<  
gk+$CyjJ  
s9 '*Vm  
_zQ3sm  
|qS<{WZ!h  
iVM{ L  
范例: 分子图,按其氧化状态标记所有的碳原子和氮原子 DCfV  
XDvT#(Pu  
W?m?r.K?  
1MdVWFKXV  
^Bihm] Aq  
dA<PQKm  
模式匹配
MoleculeMatchQ 36D-J)-Z  
  • 加入其他 Molecule 模式匹配函数: ET4 C/nb  
    "1rZwFI0l  
  • FindMoleculeSubstructure
  • MoleculeContainsQ
  • MoleculeFreeQ
  • MoleculeSubstructureCount
    zmI?p4,  
检验两个分子是否相互匹配:
}}v04~  
检验分子是否与化学式相匹配: ]p~QdUR(  
Do}mCv  
检验分子是否与模式相匹配: .$>?2|gRv  
rt5UT~  
MjMPbGUX{  
一个双原子分子可以与键相匹配: #`5 M( o  
$l:?(&u  
.IYE+XzV  
8o~<\eF%  
默认情况下,立体异构体之间不匹配: ]@bo;.  
u]P0:)tS.  
范例:绘制糖的二维图,用原子的立体感来标记原子 VIL #q  
@RKw1$BA  
k*\=IacX0  
vB, X)  
范例:使用子结构模式过滤异构体列表 ;p%a!Im_ <  
  • 找到在氧和氮之间有一个芳香键的咖啡因的异构体,并将它们排列在最大的共同子结构上 95giqQ(N  
  • 本范例使用了 FindIsomers、MoleculeContainsQ、MoleculeMaximumCommonSubstructure 和 MoleculeAlign !8]W"@qb  
z#b31;A@$  
&#Sg1$/+  
D,+I)-k<  
{ hUbK+dKZ  
  • 现在在三维空间中排列所有分子 "V:B-q  
Ow=`tv$l  
Rxld$@~-(]  
化学转换
计算 2300 毫克钠所含的毫摩尔数: F(/^??<5  
@= )_PG  
计算 10 毫升水的分子数: :NHh`@0F  
1tG,V%iCp  
计算 10 摩尔氦气的体积,单位为立方英尺: }9e4?7  
>4=sEj  
C,-q2ry  
有多少摩尔的二磷酸三钙 Ca3(PO4)2 |{HtY  
D!TL~3d 1  
计算 Ca3(PO4)2 和 Ca(OH)2  的化学计量比率 $(_Xt-6  
0mL#8\'"  
将 5 克的 Ca(OH)2 转换为 Ca3(PO4)2: PL<q|y  
R% XbO~{u  
nK Rx_D$d  
FeatureSpacePlot
r: n^U#  
12.3 版本为分子对象引入了新的内置特征提取器。 XXacWdh \  
ciI;U/V  
j2 "j Cv  
<R}(UK  
|_HH[s*U  
a;m-Vu!  
Wolfram 化学资源
`p9h$d  
一个为 Wolfram 世界中化学内容资源而策划的门户。 m6QlIdl  
  • 化学工具 Z2`(UbG}  
Wolfram|Alpha——使用自然语言的化学计算器Wolfram|Alpha 笔记本编辑器 ——数字笔记本中的多步骤化学计算Wolfram 演示项目 ——交互式化学演示工具Wolfram 语言——化学函数的分子系列 RUm1;MWs  
Wolfram 函数资源库——专业化学函数 "YHqls}c  
Wolfram 数据资源库——可计算化学数据组 C/ow{MxA  
  • 计算器 | "DQ^)3Pi  
减少认知负荷,促进实验设计中更深层次的化学思维。 `TKe+oS)  
l,HMm|oU  
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【13.2.1中英文 Wolfram 软件】欢迎评论区留言
L~SM#?z:ue  
"zR+}  
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